まだ設定しきれていないですが、Googleには、全角半角などを勝手に変えられてしまう挙動がいくつかあります。
少しづついろいろ調整していかなければなりません。単語登録はもちろん少しづつやればよいのですが、根本的なところで頭が良すぎるのかバカなのか。半角数字にするか全角数字にするかなどシビアにやっている者にとっては注意が必要。
一番忙しい時期にATOKをやめたのは間違えだったかもしれませんが、大丈夫。ちょっとづつ調整していきましょう！

まだもうちょっと調整が必要と思われますが、だいたいOK

追記）文章にカーソルを入れたとき、勝手に半角になってしまう挙動はInDesign2025の問題のようでした。いくつかは解決済み。